Die Menschheit hat es geschafft: Durch den per Umweltverschmutzung verstärkten Treibhauseffekt, ist das Eis an den Polarkappen geschmolzen. Es gibt nur noch wenige Orte, wo Menschen leben können - und als ob das nicht schon schlimm genug wäre, schmiedet ein verrückter Professor, der durch Kreuzungen zwischen Mensch und Tier eine neue Rasse von Hybridwesen erschaffen hat, auf seiner Insel Pläne zur Vernichtung der Menschheit. Die übrig gebliebenen Staaten wollen das natürlich nicht zulassen und schicken ihre verbliebenen Kriegsschiffe los, um den Professor und dessen Ungeheuer aufzuhalten. Eines der Schiffe ist die Blue 6, ein hochentwickeltes U-Boot, dessen Crew im Militär hohes Ansehen genießt. Zwei Mitglieder dieser Crew sollen heimlich auf die Insel geschleust werden, um den Wahnsinn des Professors zu stoppen. Die junge U-Boot-Pilotin Mayumi Kino und der Kriegsveteran Tetsu Hayami machen sich, wie befohlen, auf den Weg, um das Unheil aufzuhalten, bevor alles zu spät ist.
Blue Submarine No. 6 (Staffel 1)

Blues (Folge 1)
Autor: Hiroshi Yamaguchi
Sendedatum: 1998-10-25
Laufzeit: 30 min
Übersicht: Humanity is plagued with attacks by a race of sea mutants dedicated to eradicating mankind. Our last hope is the Blue Submarine No. 6 and her crew, made up of the best personnel available as they fight for the fate of all mankind.

Pilots (Folge 2)
Autor: Hiroshi Yamaguchi
Sendedatum: 1999-02-25
Laufzeit: 30 min
Übersicht: After surviving another undersea battle with Zorndyke’s forces, the crew of Blue Submarine No. 6 returns to base for repairs. While on base, Tetsu continues to display his trademark lack of concern for authority and continues to annoy Mayumi.

Hearts (Folge 3)
Autor: Hiroshi Yamaguchi
Sendedatum: 1999-08-25
Laufzeit: 30 min
Übersicht: Tetsu drifts in the open sea. As his life flashes before him, he begins to black out. But when he comes to, he finds himself resting on the hull of a half-sunken ship. His savior is one of the enemies.

Minasoko (Folge 4)
Autor: Hiroshi Yamaguchi
Sendedatum: 2000-03-25
Laufzeit: 30 min
Übersicht: The poles are shifting and most of the Earth’s land is now underwater! The scientist Zorndyke has created a race of beast people to challenge the humans for global supremacy. But who is the real enemy — Zorndyke or humanity itself?
