Dr. Light und Dr. Wily sind zwei geniale Wissenschaftler und arbeiten gemeinsam an neuer Robotertechnik. Eines Tages entwickeln sie einen sehr fortschrittlichen Prototyp. Doch kurz nach dessen Aktivierung beginnt dieser willkürlich das Labor zu zerstören. Dr. Light nimmt an, dass das Führungssystem des Prototyps, das Dr. Wily persönlich programmiert hat, Ursache des Problems ist und schlägt vor nochmal ganz von Vorne anzufangen. Dr. Wily sieht dies aber als Beleidiung seiner Genialität an und versucht in der darauffolgenden Nacht die Baupläne zu stehlen, wird aber von Dr. Light erwischt. Dennoch schafft es Dr. Wily ihn zu überwältigen und zusammen mit dem Prototyp zu entkommen. In seinem neuen Unterschlupf modifiziert er diesen dann zu Proto Man.
Mega Man (Staffel 1)

The Beginning (Folge 1) 10.0
Autor: Mark Jones
Sendedatum: 1994-09-11
Übersicht: Mega Man, Rush and Roll are defeated by Dr. Wily and his robots at the city airport. While he makes repairs, Dr. Light recalls when he created Mega Man.

Electric Nightmare (Folge 2) 10.0
Autor: Jeffrey Scott
Sendedatum: 1994-09-18
Übersicht: Dr. Wily's new device takes over the city power grid, wreaking havoc for the citizens.

Mega-Pinocchio (Folge 3)
Autor: Michael Maurer
Sendedatum: 1994-09-25
Übersicht: Mega Man's attempt to become human leads to Dr. Wily working to reprogram him.

The Big Shake (Folge 4)
Autor: Richard Merwin
Sendedatum: 1994-10-02
Übersicht: Dr. Wily has found a way to create earthquakes and demands the city surrender or be destroyed.

Robosaur Park (Folge 5)
Autor: Jeffrey Scott
Sendedatum: 1994-10-09
Übersicht: A de-evolution serum that only has an affect on robots is released.

The Mega Man in the Moon (Folge 6)
Autor: Jeffrey Scott
Sendedatum: 1994-10-11
Übersicht: Dr. Wily plots to gain control of a giant laser on the moon. Mega Man follows him up into space to stop him.

20,000 Leaks Under The Sea (Folge 7)
Autor: Martin Pasko
Sendedatum: 1994-10-23
Übersicht: An underwater mining operation falls under attack by Dr. Wily, who traps Dr. Light and Mega Man in a small prison.

Incredible Shrinking Mega Man (Folge 8)
Autor: Gary Greenfield
Sendedatum: 1994-10-30
Übersicht: Dr. Wily intends to use his new shrink ray on several cities, but his Robot Masters turn it on Mega Man.

Bot Transfer (Folge 9)
Autor: Richard Merwin
Sendedatum: 1994-11-06
Übersicht: Dr. Wily has built a teleporter, which doubles as a body switcher, resulting in Mega Man and Snake Man trading bodies.

Ice Age (Folge 10)
Autor: Jeffrey Scott
Sendedatum: 1994-11-13
Übersicht: Dr. Wily gets his hands on some super freeze technology, which he hopes will force city leaders to leave. But Ice Man gets the feeling Air Man is replacing him and switches sides.

Cold Steel (Folge 11)
Autor: Michael Maurer
Sendedatum: 1994-11-20
Übersicht: Dr. Wily's robots disguise themselves like a rock band to unleash a mind controlling music. Only Mega Man, Roll and a young deaf girl remain unaffected.

Future Shock (Folge 12)
Autor: Michael Maurer
Sendedatum: 1994-11-27
Übersicht: Dr. Light's time machine sends Mega Man to a future where Dr. Wily controls the planet. Mega Man must find a way home and save this future.

The Strange Island of Dr. Wily (Folge 13)
Autor: Richard Merwin
Sendedatum: 1994-12-04
Übersicht: Dr. Wily's new invention strands the good guys and the bad guys together on an island. They'll have to work together to escape the island.
